La arqueologa Nina Wilde ha descubierto un hallazgo insolito: un asentamiento submarino que existo mas de cien mil años antes que cualquier otra cultura conocida. Pero antes de poder sacar conclusiones, su barco es atacado, y sus pruebas robadas. Decididos a resolver el misterio, Nina y su prometido, Eddie Chase, inician un viaje en busca de respuestas. Todos sus pasos son vigilados, sin embargo, por una organizacion religiosa clandestina, la Alianza del Genesis.
La Alianza, que representa a tres de las religiones mas poderosas del mundo, no se detendra ante nada para mantener el descubrimiento de Nina en secreto ya que, ademas de que este contradice la mitologia de la creacion que todos ellos comparten, tal vez quieran reclamar para si mismos el hallazgo arqueologico mas valioso de todos los tiempos.